Podczas walki Dana z Magnusem oglądamy wyewoluowanego bakugana. Ekipa dostaje zagadkowe wezwanie, rusza na poszukiwania bakugana i trafia do dziwnego miejsca.
Chcąc pozostać w ekipie, Shun staje do walki bakuganów, która może odmienić jego życie. Dan i Shun walczą o przywództwo, a na horyzoncie pojawia się nowe zagrożenie.
Shuna odwiedza pewna osoba, która ma dla niego złą wiadomość. Do akcji wkracza też niespodziewany przeciwnik. Drago i inne bakugany mają zagadkową wizję.
Dowiedziawszy się o istnieniu więzienia dla bakuganów, ekipa udaje się do niebezpiecznego labiryntu. Wojownicy muszą wspólnymi siłami znaleźć drogę ucieczki.
Bakugany uwięzione w labiryncie spotykają alternatywną wersję wojowników. Po opuszczeniu Vestroii ekipa z radością wraca do domu — ale czy na pewno to jest ich dom?
Gdy władzę nad bakuganami przejmują mroczne siły, Drago i ekipa używają potężnego źródła mocy, aby je powstrzymać. Nieco później Tiko próbuje zniszczyć Główny Bakurdzeń.
Po opuszczeniu labiryntu Ekstra Ekipa wykorzystuje cenną wiedzę bitewną w praktyce. Później wojownicy zastanawiają się, co zrobić z bakuganem przypominającym miśka.
Shun staje do walki z kuzynem, a ekipa próbuje wyewoluować swoje bakugany. Najpierw wojownicy muszą jednak znaleźć sposób na wydobycie energii z Głównego Bakurdzenia.
Zafascynowana filmowaniem bakuganów Lia próbuje wyewoluować Pegatrix. Dan próbuje oszukać przyjaciół, a Duran Dane liczy na pojedynek z ulepszonym bakuganem.